Hastane kökenli koagülaz negatif stafilokok suşlarında oksasilin direncinin moleküler ve geleneksel yöntemlerle araştırılması [Evaluation of oxacillin resistance by traditional and molecular methods in nosocomial strains of coagulase negative staphylococci]

ÖZET Hastane Kökenli Koagülaz Negatif Stafilokok Suşlarında Oksasilin Direncinin Moleküler ve Geleneksel Yöntemlerle Araştırılması Dr. Hasan PEKSEL Danışmanlar: Prof. Dr. Ayşe YÜCE, Doç. Dr. Nur YAPAR Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, nfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji A.D. ZM R Amaç: Hastane kökenli koagülaz negatif stafilokoklarda (KNS) metisilin direncinin, Klinik ve Laboratuvar Standartları Enstitüsü-CLSI önerileri doğrultusunda, farklı yöntemlerle gösterilmesi planlandı. Gereç yöntem: Nisan 2005 ile Eylül 2005 tarihleri arasında kan kültürlerinden elde edilen ve hastane kökenli oldukları belirlenen 105 KNS izolatı çalışmaya alındı. Bu KNS izolatlarında, metisilin direncini göstermek üzere CLSI önerileri doğrultusunda; oksasilin ve sefoksitin disk difüzyon testleri, oksasilin agar dilüsyon testi ve mecA-PCR gerçekleştirildi. Bulgular: Çalışılan 105 KNS izolatının Oksasilin disk difüzyon testine göre izolatların 82’si oksasiline dirençli, 23’ü duyarlı bulundu. Sefoksitin disk difüzyon yöntemine göre izolatların 80’i sefoksitine dirençli, 25’i duyarlı bulundu. Oksasilin agar dilüsyon testine göre ise izolatların 84’ü oksasiline dirençli, 21’i duyarlı bulundu. KNS’lerin mecA-PCR yöntemi ile 83’ünde mecA geni gösterilirken, 22’sinin mecA geni negatif bulundu. statistiksel analiz: Dört gözlü tablo ile elde edilen verilere göre; oksasilin disk difüzyon, sefoksitin disk difüzyon ve oksasilin agar dilüsyon yöntemlerinin altın standart olarak kabul edilen mecA-PCR yöntemine göre duyarlılıkları sırasıyla yüzde 97.59, 96.38, 100 ve seçilikleri sırasıyla yüzde 95.45, 100 ve 95.45 olarak bulunmuştur. Testlerin ROC eğrisi altında kalan alana göre; fenotipik yöntemlerden sefoksitin disk difüzyon testi diğer yöntemlere göre altın standart teste en yakın test olarak bulunmuştur. Sonuç: Stafilokoklarda heterojen dirençli suşlar nedeniyle metisilin direncinin fenotipik yöntemlerle gösterilmesi sıklıkla yanlışlıklara neden olmaktadır. Sefoksitin disk difüzyon yönteminin oksasiline göre metisilin direncini göstermedeki üstünlüğü bizim çalışmamızda da belgelenmiştir. Ancak en ideali; hem KNS’lerde hem de S.aureus’ta metisilin direncinin belirlenmesinde altın standart olarak kabul edilen PCR ile mecA geni saptanması yönteminin giderek rutin laboratuvarlarda da kullanıma girmesidir. Anahtar kelimeler: Koagülaz negatif stafilokok, duyarlılık testleri, oksasilin direnci.

Abstract Evaluation of Oxacillin Resistance by Traditional and Molecular Methods in Nosocomial Strains of Coagulase Negative Staphylococci PEKSEL Hasan, MD. Advisors: YÜCE Ayşe, MD, Professor of Infectious Diseases and Clinical Microbiology and YAPAR Nur, MD, Assoc. Professor of Infectious Diseases and Clinical Microbiology Dokuz Eylul University Faculty of Medicine, Infectious Diseases and Clinical Microbiology Department Izmir / Turkey Purpose: To detect the methicillin resistance in nosocomial strains of coagulase negative staphylococci (CoNS) by different methods according to the Clinical Laboratory Institute (CLSI) suggestions. Materials and methods: Nosocomial strains of 105 CoNS were isolated from blood cultures between April to September 2005. To detect the methicillin resistance; oxacillin and cefoxitin disc diffusion tests, oxacillin agar dilution test and mecA polymerase chain reaction (PCR) were conducted according to the CLSI suggestions. Results: By the oxacillin disc diffusion test; 82 isolates were resistant and 23 were susceptible to oxacillin. By the cefoxitin disc diffusion test; 80 isolates were resistant and 25 were susceptible to cefoxitin. By the oxacillin agar dilution test; 84 isolates were resistant and 21 were susceptible to oxacillin. By the method mecA-PCR; 83/105 of isolates were mecA positive and 22/105 were mecA negative. Statistical analysis: By the data gained from the four-filled table; the sensitivity of oxacillin disc diffusion test, cefoxitin disc diffusion test and oxacillin agar dilution tests when compared with the gold standard test mecA-PCR were; 97.59%; 96.38% and 100% respectively. The specificity of the tests were; 95.45%; 100% and 95.45% respectively. By the results of the ROC analysis, cefoxitin disc diffusion test was the most concordant test reflecting the results of gold standard method mecA-PCR Conclusion: Evaluating methicillin resistance in staphylococci by phenotypic methods will mostly cause inaccuracy. The results of our study showed that the cefoxitin disc diffusion test is preferable to the oxacillin disc diffusion method. But it’s considered that the gold standard method mecA-PCR must be used in the routine laboratory to show the methicillin resistance in both CoNS and S.aureus. Key words: Coagulase-negative Staphylococci, susceptibility testing, oxacillin resistance